Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GRIK4Q16099 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms