Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms