Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIP13Q15645 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms