Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SYCP1Q15431 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SYCP1Q15431 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SYCP1Q15431 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SYCP1Q15431 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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