Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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