Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HERPUD1Q15011 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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