Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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