Protein–RNA interactions for Protein: Q14693

LPIN1, Phosphatidate phosphatase LPIN1, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN1Q14693 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LPIN1Q14693 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LPIN1Q14693 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms