Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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