Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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