Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
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