Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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