Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRSQ13332 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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