Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms