Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms