Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.922e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-215ENST00000508161 475 ntTSL 39.33□□□□□ -0.924e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-215ENST00000580886 562 ntTSL 29.27□□□□□ -0.932e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-231ENST00000584054 716 ntTSL 29.27□□□□□ -0.932e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TROAP-206ENST00000547923 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.931e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-232ENST00000584712 782 ntTSL 29.22□□□□□ -0.932e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.949e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AC008764.4-206ENST00000594509 479 ntTSL 29.18□□□□□ -0.949e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-203ENST00000395634 1468 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TNIP1-210ENST00000521423 926 ntTSL 59.13□□□□□ -0.959e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 59.1□□□□□ -0.951e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 59.08□□□□□ -0.962e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-206ENST00000533011 733 ntTSL 59.06□□□□□ -0.969e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-226ENST00000582848 591 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.989e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.989e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.989e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PHKA2-208ENST00000486231 317 ntTSL 58.69□□□□□ -1.029e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TOP3A-211ENST00000581536 766 ntTSL 58.64□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.031e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-222ENST00000531361 637 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.039e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-219ENST00000509979 771 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MED26-206ENST00000601478 558 ntTSL 48.46□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-221ENST00000630607 1873 ntTSL 38.43□□□□□ -1.064e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MYO19-201ENST00000610496 578 ntTSL 38.42□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-205ENST00000531158 563 ntTSL 48.42□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FKBP11-205ENST00000546847 524 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.081e-9■■■■□ 24.7
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SF3A3Q12874 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 58.29□□□□□ -1.081e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.089e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL672142.1-201ENST00000482796 378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.14e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.129e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANKRD27-209ENST00000593232 558 ntTSL 28.06□□□□□ -1.129e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.159e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.169e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AC008764.4-204ENST00000595505 400 ntTSL 27.74□□□□□ -1.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.189e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 C2-214ENST00000485690 894 ntTSL 57.61□□□□□ -1.199e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MAPK14-208ENST00000491957 2777 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AC008764.4-205ENST00000593459 222 ntAPPRIS P1 TSL 37.47□□□□□ -1.219e-7■■■■□ 24.7
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SF3A3Q12874 MTFR1L-205ENST00000424294 756 ntTSL 57.42□□□□□ -1.221e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CBFA2T2-208ENST00000491618 865 ntTSL 57.4□□□□□ -1.222e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.239e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 24.7
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SF3A3Q12874 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.269e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.279e-7■■■■□ 24.7
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SF3A3Q12874 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 57.03□□□□□ -1.282e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AC008764.4-201ENST00000593962 468 ntTSL 27.02□□□□□ -1.299e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-222ENST00000514515 3564 ntTSL 1 (best)7.02□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-212ENST00000579085 569 ntTSL 47□□□□□ -1.292e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.299e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 56.95□□□□□ -1.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-209ENST00000542700 847 ntTSL 36.94□□□□□ -1.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.319e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.311e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MAPK14-205ENST00000472333 585 ntTSL 56.8□□□□□ -1.329e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ACIN1-215ENST00000555395 514 ntTSL 26.79□□□□□ -1.321e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-209ENST00000493418 1496 ntTSL 26.67□□□□□ -1.341e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 26.64□□□□□ -1.351e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TMPO-213ENST00000556678 713 ntTSL 56.6□□□□□ -1.359e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TMPO-207ENST00000548223 736 ntTSL 26.6□□□□□ -1.359e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DNMT1-224ENST00000591764 341 ntTSL 1 (best)6.59□□□□□ -1.355e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-216ENST00000549089 555 ntTSL 46.56□□□□□ -1.369e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ELOVL6-204ENST00000506461 575 ntTSL 46.51□□□□□ -1.379e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.379e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MAPK14-209ENST00000496250 2750 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.49e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 LARP1-209ENST00000519194 529 ntTSL 26.33□□□□□ -1.49e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.414e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-210ENST00000552620 716 ntTSL 26.23□□□□□ -1.419e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GNL3-208ENST00000479230 547 ntTSL 46.22□□□□□ -1.419e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GNL3-204ENST00000462550 597 ntTSL 26.22□□□□□ -1.419e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 36.04□□□□□ -1.442e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AC008764.4-203ENST00000593991 548 ntTSL 26.03□□□□□ -1.449e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.459e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ERCC6L2-206ENST00000466840 3586 ntTSL 1 (best)5.93□□□□□ -1.469e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.479e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 24.7
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