Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHD3Q12873 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHD3Q12873 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHD3Q12873 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHD3Q12873 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHD3Q12873 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHD3Q12873 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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