Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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