Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROQ12816 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROQ12816 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROQ12816 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROQ12816 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TROQ12816 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TROQ12816 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TROQ12816 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROQ12816 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
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