Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms