Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms