Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLEQ07864 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLEQ07864 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLEQ07864 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLEQ07864 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLEQ07864 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLEQ07864 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLEQ07864 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms