Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms