Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms