Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms