Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms