Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLE4Q04727 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms