Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RELAQ04206 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RELAQ04206 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms