Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4A11Q02928 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms