Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms