Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN7AQ01118 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms