Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms