Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms