Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms