Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2C1P98194 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms