Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms