Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL20P78556 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL20P78556 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL20P78556 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL20P78556 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL20P78556 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL20P78556 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCL20P78556 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCL20P78556 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL20P78556 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL20P78556 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCL20P78556 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCL20P78556 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCL20P78556 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCL20P78556 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCL20P78556 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCL20P78556 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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