Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX6P78412 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX6P78412 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX6P78412 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX6P78412 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX6P78412 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms