Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOMO3P69849 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms