Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms