Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms