Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2FP61218 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms