Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA3P59666 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms