Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA1P59665 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA1P59665 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms