Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms