Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VSX2P58304 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms