Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms