Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK1P57059 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK1P57059 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK1P57059 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK1P57059 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK1P57059 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK1P57059 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms