Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms