Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms